Отдел осуществляет научно-исследовательскую и учебно-методическую работу по следующим научно-практическим направлениям:

  • использование систем распределённых вычислений в обработке данных и моделировании в медицине (HPC)
  • технологии искусственного интеллекта в медицине (AI)
  • получение, обработка и распознавание медицинских изображений (medical imaging)
  • вычислительная гидродинамика (CFD)
  • системы содействия принятию решения в медицине (DSS)
  • интеграция прорывных вычислительных технологий в практпческое здравоохранение.

В состав отдела входят лаборатория систем анализа и обработки медицинских данных (зав. В.Н. Гусев) и лаборатория математического моделирования в медицине.

Технологии и оборудование

Действующие технологии

  • Высокопроизводительные вычисления (распараллеливание на картах nVidia GPU, Xeon Phi)
  • Вычислительная гидродинамика на пакете FlowVision HPC edition (ТеСиС, Москва)
  • Нейронные сети (фреймворки TensorFlow-Keras, Caffee2, PyTorch, MXTeano)
  • Обработка данных DICOM (собственная разработка - система медицинской визуализации "Луч-С")
  • Разработка на различных языках программирования и платформах (C++, Python, Java, Wolfram, R)

Оборудование

Основной вычислительной мощностью отдела является гибридный вычислительный суперкомпьютер ВЕТЕРОК, построенный на базе платформы Supermicro с использованием CPU Xeon PHI и GPU nVidia. СК работает под управлением операционной системы GNU/Linux. Пиковая производительность 14 ТФлопс, в 2018 году запланировано техническое переоснащение кластера для повышения вычислительной мощности.

СК Ветерок интегрирован с аппаратным PACS-сервером, входящий в состав изделия «ЛУЧ-С». На нем производится обработка и хранение медицинских изображений, генерируемых в Клиниках ФГБОУ ВО СамГМУ Минздрава России.

На кластере в том числе реализуются вычисления, предоставляемые заказчикам из других учреждений - МГУ имени М.В. Ломоносова.

Для решения специальных задач отдел использует вычислительный комплекс, построенный на базе микропроцессора "Эльбрус" (ОАО "МЦСТ", Москва). Отдел располагает устройством Jetson (nVidia).

Для сложных задач отдел использует вычислительные ресурсы до 100 ТФлопс, предоставляемые НИЦ "Курчатовский институт"

Достижения

Участники в конгрессе «Параллельные вычислительные технологии 2015»
Коорганизаторы семинара по биомедицинским вычислениям в Университете ИТМО 2015
Участники летней суперкомпьютерной академии 2015
Участники школы МФТИ на базе Иннополиса 2015
Организаторы семинара «Вычислительные технологии nVidia» в СамГМУ
Организаторы семинара «Технологии распределенного хранения данных RedHat» в СамГМУ
Участники GPU Technology Conference 2016
Участники Национального Суперкомпьютерного Форума (НСКФ-2017)
Участники международного научно-практического форума «Российская неделя здравоохранения»

Контакты

Отдел высокопроизводительных вычислений и технологий искусственного интеллекта

Самара, ул. Чапаевская, д. 227